石室书院位于药师佛道场石室禅院内,禅院创建于唐垂拱二年(686年),是闽南地区最古老的寺院之一。书院于2016年4月成立,致力于传承和弘扬中华传统文化,推广与发展健康教育,以家庭和社区为单位,开展各类文化和健康教育课程及活动。
2017年6月18日,厦门市石室书院举办“海峡两岸交流基地”授牌仪式,该基地成为全国第56家“海峡两岸交流基地”。
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