2日，首届跨海峡马拉松邀请赛平潭段比赛开跑，来自两岸的696名马拉松选手和长跑爱好者参与赛事角逐。这是在平潭举办的首次马拉松赛事，也是大陆马拉松赛首次跨越海峡、串联两岸的马拉松赛事。
3日，中国国民党副主席林丰正率台湾企业界、教育界、医疗卫生界人士到漳州参访。在漳期间，林丰正一行实地考察了圆山新区、漳州台商投资区等地，详细了解区域规划情况。
3日，由福建省行政学院承办的首届台湾中小企业经贸文化交流班在福州开班。30多名来自台湾工商界的中小企业主，接受福建省知名专家以及相关领域负责人的专题讲授，内容涵盖海峡西岸经济区规划与发展、闽台交流、闽台产业对接等多领域。
12日，第七届闽台对渡文化节暨蚶江海上泼水节在石狮开幕，台湾鹿港参访团、台湾谜学研究会等机构的近百位同胞与当地居民一起庆祝端午佳节。
13日，第五届海峡论坛·闽台佛教文化交流周在厦门开幕，闽台佛教界厦门再续法缘。交流周期间，闽台佛教界分别在厦门和金门举办两岸和平祈福法会、佛教教育交流研讨会等活动，两岸佛教界高僧大德、相关寺庙及佛教会负责人共计300多人参加。
13日，“闽台同名村镇续缘之旅”在厦门启动，来自闽台两地的数百民众参加活动。本次续缘之旅为期６天，来自台南市安平区、嘉义县双溪里、嘉义县六斗厝、彰化县舜田村、桃源县大溪镇、基隆市南靖村等350名台湾乡亲分别“对口”探访了福建省泉州市和漳州的相关镇村。
13日，“2013年海峡两岸心理健康研讨会”在福州举行。海峡两岸300余位专家学者就“魅力女性，幸福家庭，和谐社会”主题展开研讨。
13日，妈祖文化活动周在莆田湄洲岛举行。作为第五届海峡论坛首站活动，妈祖文化活动周举办了台湾千尊妈祖湄洲谒祖进香、翡翠妈祖像开光典礼暨妈祖祭祀大典、两岸妈祖宫庙联谊交流、两岸妇女联谊交流等活动。
14日，第四届海峡两岸船政文化研讨会在福建会堂举行。来自中国军事科学院、台湾大学等科研院所的专家和林则徐、沈葆桢等船政家族的后人就船政文化与中华文化的发展、船政文化与国家软实力的增强、船政精神与国防力量的增强、船政精神与维护国家海洋权益等论题展开研讨。当天海峡两岸船政文化交流周活动同步拉开帷幕，与会代表前往福州马尾区参加船政与台湾专题展、船政后裔恳亲祈福活动等活动。
14日，两岸首次联合主办的第五届海峡论坛·郑成功文化节在台湾和厦门两地同时举行。文化节活动主会场设在台南，包括台湾郑成功庙建成350周年大典、郑成功神像巡游活动、厦门市思明区旅游推介等。文化节开幕当日，思明区群众文化协会和厦门郑氏宗亲会组织了168人从厦门包机直飞台南参加典礼。本届郑成功文化节由厦门市两岸交流协会、厦门市中华文化联谊会、厦门市旅游协会、台南市文化协会、全台奉祀郑成功联合会等联合主办，首次实现了两岸联合主办。
14日至19日，第五届海峡论坛·台湾特色庙会在厦门、福州、泉州三地举办。今年的庙会活动内容更加丰富，云集来自台湾各地的特色小吃和名优特产。庙会还举办台湾特色小吃和名优特产展、闽台民俗演出、台湾县市图片展、台湾县市推介会、台湾金牌小吃评选、海峡两岸烘焙师和咖啡师职业技能赛等10多项活动，受到台湾参展业者和市民游客欢迎和好评。
15日，第五届海峡论坛·海峡两岸关爱下一代成长论坛在厦门开幕，来自中国关心下一代工作委员会、台湾教育会等两岸百家机构、400余名代表参加了论坛开幕式。
15日第五届海峡论坛·两岸特色乡村对接暨农民合作组织发展交流会在厦门举行。来自大陆的农业专家、基层农技干部、福建农民合作社的代表，与来自台湾中南部基层的农民、农会、农业产销组织的代表及在大陆发展的台湾农民等，共200多人参加了交流会。会上，50家福建农民合作社和台湾50个农业产销组织开展对接交流活动，并签订对接合作交流协议。
15日，第五届海峡论坛·海峡金融论坛在厦门召开，厦门国际金融管理学院与台湾金融研训院签署合作协议，约定建立合作机制，共同培训两岸金融业人才。
15日，第五届海峡论坛·海峡两岸民生气象论坛在厦门开幕，来自两岸的70多位海洋渔业、海运、海上救助、旅游、农业等各界气象用户代表及气象、水文水利专家学者代表以“深化气象交流，惠泽两岸民生”为主题，为共同构建“平安海峡、和谐海峡、活力海峡”献计献策。
15日，以“中国梦·中华情”为主题的第十一届海峡青年论坛在厦门大学举行，来自海峡两岸的千名青年代表参加论坛。本届论坛还首次举办了“两岸青年创业家园论坛”，推出了“两岸青年创业基地”规划方案、优惠政策及扶持措施，同时还首次举办两岸青年金融峰会及两岸青年金融研讨会，就进一步加强两岸金融合作展开探讨。
16日，漳州市人民政府在漳州科技学院举行海峡两岸新型农民交流培训基地揭牌仪式，同时首期培训班开班。该基地由省台办、省农业厅批准设立。
16日，第五届海峡论坛·海峡新闻出版业发展论坛在厦门召开，国家新闻出版广电总局出台五条支持福建先行先试、惠及台胞的新闻出版政策，分别是决定批准设立海峡国家数字出版基地、国家海峡版权交易中心，同意设立新闻出版总署教育培训中心福建分中心，允许在福建新闻出版单位从业的台湾业者参加出版职业资格考试，同意福建省新闻出版局开展加强国产网络游戏属地管理试点工作等。
16日，以“两岸同根，闽台一家”为主题的第五届海峡论坛·海峡百姓论坛在漳州开幕。来自两岸的有关姓氏宗亲代表和专家学者千余人与会。论坛内容突出“中国梦与谱牒文化”，举办了两岸宗亲族谱对接仪式、闽台族谱展、中国梦与谱牒文化研讨会等主题活动。两岸22个姓氏宗亲还现场进行族谱对接，13对姓氏研究团体还签订长期交流合作协议，建立经常性学术互动机制，全方位开展姓氏宗亲源流研究。
16日，第五届海峡论坛·两岸基层调解员交流会在厦门举办，海峡两岸百余名基层调解员共聚一堂，交流调解经验，探讨排难解纷之道，期盼未来进一步深化合作。
16日，以“家庭和谐文化绽放”为主题的第五届海峡论坛?海峡妇女论坛在厦门开幕。来自两岸四地各界妇女近600人参加本届海峡妇女论坛，围绕两岸和谐家庭文化议题进行了探讨和交流。
16日，以“眼视光领域——新视界”为主题的海峡两岸职业教育合作发展论坛在厦门举行。来自两岸及英国的眼视光领域专家围绕两岸眼视光学的现状、人才培养、技术推动应用等问题展开研讨和交流。论坛期间，两岸院校校长还就办学及学术交流等达成多个合作意向。
16日，第六届海峡物流论坛在福建厦门开幕。两岸多家企业分别就共建海峡汽车国际营运中心、海峡现代城项目以及关务项目合作等签订协议。主办方还于18日至24日在高雄举办了首届两岸（高雄）物流论坛系列活动。
16日，2013年海峡两岸（平潭）沙滩文化节在平潭龙凤头海滨浴场拉开序幕。本届沙滩文化节的主题是“美丽平潭 共同家园”，由广场文化、沙滩休闲、台湾美食、沙雕园区四大板块组成，活动历时100天。
16日，第五届海峡论坛·2013世界闽南文化节在泉州开幕，闽南风 四海情》文艺晚会、世界闽南文化展示中心开展仪式、闽南文化论坛、世界华文媒体闽南文化泉州行、南少林武术系列活动、第十届泉州国际南音大会唱、戏曲精品剧目展演等活动陆续举行，来自36个国家和地区的4000多名嘉宾共襄盛举。
16日，第五届海峡论坛·两岸未来科技型农民研讨会在厦门举办，160多名两岸代表围绕提升农村劳动力素质、培育未来科技型农民，研讨对策措施，发展现代农业，促进农民增收等问题开展了交流研讨。
16日，经国家新闻出版广电总局批准海峡国家数字出版产业基地福州、厦门两个园区举行授牌仪式。基地前期以福州软件园、厦门软件园现有成熟、可拓展的国家级品牌园区为核心和重点，规划陆域面积约25平方公里，后期以福州、厦门两个数字出版产业圈为基点，构筑福州、莆田、泉州、厦门、漳州印刷园区及高新技术园区沿海数字出版产业带，并向平潭综合实验区拓展。这一围绕促进两岸交流合作、突出闽台特色的基地，将培育发展年产值超百亿元的文化产业。
